【文件属性】:
文件名称:Zi-LN
文件大小:125KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-22 02:14:45
R
紫宁
该存储库是用于生成文章“用于推理稀疏微生物关联网络的零膨胀对数正态模型”的实验结果的代码库。本文中介绍的推理方法在脚本和以及其他用于基准测试的方法中实现。
R包依赖
SpiecEasi(1.0.7)
统计资料
雷玛格玛(0.93)
QUIC(1.1)
巨大的(1.3.4)
JuliaCall(0.17.1)
optparse(1.6.6)
ggplot2(3.3.2)
ggh4x
图2
./draw_figure_2.sh
图3
./draw_figure_3.sh
图6
./draw_figure_6.sh
【文件预览】:
Zi-LN-master
----norta.txt(66KB)
----aupr_fig_6.pdf(19KB)
----draw_figure_3.R(4KB)
----figure_6.sh(452B)
----inference.R(2KB)
----zeros_ziln.txt(57KB)
----script_command_line.R(7KB)
----aupr_fig_2.pdf(19KB)
----output.txt(199KB)
----figure_2.sh(452B)
----figure_3.sh(481B)
----aupr_fig_3.pdf(10KB)
----draw_figure_6.R(3KB)
----README.md(902B)
----draw_figure_2.R(4KB)
----test_amgut.R(3KB)
----utils.R(3KB)