文件名称：DiRT_Biophysical_Journal_2021:在doi上找到的论文代码
文件大小：319.05MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-29 17:05:52
MATLAB
DiRT_Biophysical_Journal_2021 在doi上找到该论文的代码： : 。 要运行一组新的仿真，请执行以下操作： 调整params_DiRT_cylinder.m中的参数注意：PDE-ODE参数将相应更新 运行run_both_simulations.m并回答提示（如果出现） 注意：在1秒钟的模拟时间内进行10,000个粒子模拟，大约需要10分钟，并行运行8个核（目前将试验次数设置为8） 为了更快地搜索参数，请运行run_PDE_ODE_simulations.m以仅运行完整的PDE-ODE模型和MM模型
【文件预览】：
DiRT_Biophysical_Journal_2021-main
----README.md(611B)
----PDE_Functions()
--------Full_Model_Right_Reflecting_dim.m(1KB)
--------MM_Model_Right_Reflecting_dim.m(1KB)
----DiRT_cylinder_mex.mexmaci64(33KB)
----Plot_Figure3.m(3KB)
----DiRT_Data()
--------DiRT_cyl_1000_500_0.10_1.00_0.05.mat(25KB)
--------DiRT_cyl_1000_100_0.10_1.00_0.05.mat(25KB)
--------DiRT_cyl_10000_500_0.10_1.00_10.00.mat(118KB)
--------DiRT_cyl_10000_500_0.10_1.00_0.05.mat(30KB)
--------DiRT_cyl_10000_100_0.10_1.00_0.10.mat(26KB)
--------DiRT_cyl_10000_500_0.10_1.00_1.00.mat(234KB)
--------DiRT_cyl_10000_100_0.10_1.00_0.05.mat(28KB)
--------DiRT_cyl_10000_500_0.10_1.00_0.10.mat(117KB)
--------DiRT_cyl_1000_100_0.10_1.00_1.00.mat(18KB)
--------DiRT_cyl_1000_500_0.10_1.00_1.00.mat(24KB)
--------DiRT_cyl_1000_100_0.10_1.00_0.10.mat(25KB)
--------DiRT_cyl_1000_500_0.10_1.00_0.10.mat(24KB)
--------DiRT_cyl_10000_500_0.10_1.00_100.00.mat(48KB)
--------DiRT_cyl_10000_100_0.10_1.00_1.00.mat(17KB)
----.gitattributes(66B)
----run_DiRT_and_PDE_simulations.m(4KB)
----Plot_Figure4and5.m(3KB)
----Key_Functions()
--------DiRT_cylinder_mex.c(10KB)
--------DiRT_sim_mex.m(3KB)
--------PDE_ODE_sim.m(2KB)
--------update_sim_database.m(556B)
--------place_receptors.m(2KB)
----PDE_ODE_Data()
--------PDE_ODE_cyl_10000_500_0.10_1.00_10.00.mat(57.48MB)
--------PDE_ODE_cyl_10000_100_0.10_1.00_0.10.mat(6.74MB)
--------PDE_ODE_cyl_10000_500_0.10_1.00_1.00.mat(62.78MB)
--------PDE_ODE_cyl_1000_100_0.10_1.00_1.00.mat(6.93MB)
--------PDE_ODE_cyl_1000_500_0.10_1.00_1.00.mat(7.17MB)
--------PDE_ODE_cyl_10000_100_0.10_1.00_0.05.mat(7.03MB)
--------PDE_ODE_cyl_1000_500_0.10_1.00_0.05.mat(7.25MB)
--------PDE_ODE_cyl_1000_100_0.10_1.00_0.05.mat(7.2MB)
--------PDE_ODE_cyl_10000_500_0.10_1.00_0.10.mat(72.5MB)
--------PDE_ODE_cyl_10000_100_0.10_1.00_1.00.mat(6.5MB)
--------PDE_ODE_cyl_10000_500_0.10_1.00_100.00.mat(54.81MB)
--------PDE_ODE_cyl_1000_500_0.10_1.00_0.10.mat(7.25MB)
--------PDE_ODE_cyl_10000_500_0.10_1.00_0.05.mat(7.28MB)
--------PDE_ODE_cyl_1000_100_0.10_1.00_0.10.mat(7.18MB)
----Plot_Figure2.m(2KB)
----Figures()
--------Figure4.fig(43KB)
--------Figure2.fig(123KB)
--------Figure5.fig(41KB)
--------Figure3.fig(57KB)
----.DS_Store(10KB)
----run_PDE_ODE_simulations.m(2KB)
----sim_database.mat(419B)
----Parameters()
--------params_DiRT_cylinder.m(2KB)
--------params_PDE_ODE_cylinder.m(2KB)