文件名称：matlab画一个三维图代码-WidefieldImager:广域数据的预处理管道
文件大小：6.5MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-14 20:46:41
系统开源
matlab画一个三维图代码WidefieldImager 此仓库包含一个基于Matlab的采集软件和一个用于广域成像的预处理管道。 Musall和Kaufman等人将WidefieldImager软件用于出版物“单次尝试神经动力学受变化多样的运动支配”。 用于宽场分析的文档和演示脚本是。 可以从这项研究中找到影像数据。 另请参见具有扩展功能的替代Python代码。 降维分析的某些内容来自肯尼斯·哈里斯（Kenneth Harris）和Matteo Carandini的实验室。 概述 “ WidefieldImager”文件夹包含广角采集软件。 “ LEDswitcher”包含一个Teensy微crontoller（）的代码，用于在宽视场设置中控制蓝色和紫色激发LED。 “ CAD”文件夹包含适用于头部固定成像的不同部分的3D模型，例如顶杆和夹具以及遮光锥。 “ Analysis”文件夹包含一个Matlab流水线，用于降低线性维数（使用局部奇异值分解）和对原始成像数据的血液动力学校正。 要求 对成像PC没有特殊要求。 但是，建议使用大型（> = 1TB）固态驱动器和足够的RAM（>\n=
【文件预览】：
WidefieldImager-master
----LEDswitcher()
--------LEDswitcher.ino(6KB)
----images()
--------waitForStimulus.png(407KB)
--------compareMovie_example.png(70KB)
--------takeSnapshot.png(252KB)
--------adjustLight.png(297KB)
--------wiring.png(91KB)
--------startup.png(474KB)
--------endSession.png(798KB)
--------newAnimal.png(274KB)
--------phaseMap_example.png(194KB)
--------initializeImaging.png(265KB)
----Analysis()
--------plasma.m(16KB)
--------stdshade.m(2KB)
--------svdFrameReconstruct.m(320B)
--------allenDorsalMapSM.mat(584KB)
--------splitChannels.m(11KB)
--------compareMovie.fig(2.22MB)
--------Tutorial_dimReduction.m(4KB)
--------dftregistration.m(8KB)
--------getAreaMasks.m(1KB)
--------loadRawData.m(3KB)
--------Widefield_HemoCorrect.m(3KB)
--------Tutorial_basicAnalysis.m(7KB)
--------SvdHemoCorrect.m(4KB)
--------viridis.m(12KB)
--------blockSVD.m(10KB)
--------computePhaseMapsNCAAS.m(14KB)
--------computePhaseMaps.m(13KB)
--------inferno.m(16KB)
--------blockSVD_singleChan.m(8KB)
--------magma.m(16KB)
--------arrayResize.m(2KB)
--------fsvd.m(3KB)
--------computePhaseMapsRaw.m(16KB)
--------splitChannelsTemp.m(6KB)
--------compareMovie.m(82KB)
--------checkSessionBleaching.m(3KB)
--------imageScale.m(470B)
--------arrayShrink.m(3KB)
--------README.md(6KB)
--------splitChannelsPart.m(14KB)
--------colormap_blueblackred.m(1KB)
----WidefieldImager()
--------WidefieldImager.m(73KB)
--------WidefieldImager.fig(70KB)
--------logAnalogData.m(1KB)
--------plotAnalogData.m(368B)
--------Widefield_MoveData.m(3KB)
----.gitignore(37B)
----CAD()
--------LightCone()
--------HeadbarClamp()
--------Headbars()
----README.md(9KB)