文件名称:pipeline:用于NSC,解复用和QC的数据处理管道
文件大小:183.61MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-18 12:45:26
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管道 序列数据的初始处理脚本。 有关更多信息,请参见 。 有关设置说明,请参见SETUP.md。 (当前已过时) 内容 主要脚本:主要数据处理/分析任务。 脚本以数字前缀和名称后命名。 它们按照这些数字的顺序运行。 脚本阵容经常更改,因此这里没有给出每个脚本的文档。 在每个脚本的顶部,都有一组有关其功能的关键字,但是对于其他任何事情,您都必须引用代码本身。 LIMS集成,自动化:用于管理LIMS流程/工作流程的脚本。 这些脚本支持与Clarity LIMS的紧密集成,并且可以使用LIMS内部的状态来管理工作流进度吗? lims-setup-step.py - lims-setup-step.py - lims-setup-step.py进入解复用步骤时调用,以设置源/目标文件夹并从集群生成步骤中获取样本表。 为了使用LIMS管理工作流,还需要lims存储库中的一些外部脚本。 au