sbolgraph:使用TypeScript编写的合成生物学开放语言(SBOL)库,用于浏览器或node.js中JavaScriptTypeScript应用程序

时间:2024-03-24 01:10:05
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文件名称:sbolgraph:使用TypeScript编写的合成生物学开放语言(SBOL)库,用于浏览器或node.js中JavaScriptTypeScript应用程序

文件大小:79KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-24 01:10:05

bioinformatics biology sbol synbio TypeScript

用TypeScript编写的合成生物学开放语言(SBOL)库,用于浏览器或node.js中JavaScript / TypeScript应用程序。 还移植到 。 与现有库(例如libSBOLj和sboljs)不同,sbolgraph不会尝试将SBOL RDF“加载”到面向对象的数据结构中。 相反,sbolgraph将SBOL RDF保留在RDF图中,并提供外观类似于类实例但实际上只是包装URI并在其getter / setter中查询/更新图的“ facade”类。 sbolgraph基于,该库用于在TypeScript中创建面向对象的RDF抽象。 因此,它可以与其他rdfoo抽象一起使用。 例如,sbolgraph使用的PROV-O抽象由。 迄今已实施 读取和写入SBOL1,SBOL2和SBOL3 在SBOL1,SBOL2和SBOL3之间转换 阅读(转换)FASTA和GenBank


【文件预览】:
sbolgraph-master
----.gitignore(19B)
----test.sh(114B)
----package.json(1KB)
----.travis.yml(102B)
----sbolgraph()
--------sbol1()
--------sbol3()
--------SBOL3Repository.ts(1001B)
--------URIUtils.ts(1KB)
--------SBOL2GraphView.ts(18KB)
--------SBOLFacade.ts(2KB)
--------SBOL3GraphView.ts(12KB)
--------conversion()
--------SBOL2Repository.ts(1KB)
--------extractTerm.ts(494B)
--------SBOLConverter.ts(703B)
--------testRoundtrip.ts(5KB)
--------SBOL1GraphView.ts(3KB)
--------isOwnershipRelation.ts(2KB)
--------index.ts(4KB)
--------sbol2()
----SBOLTestSuite()
----tsconfig.json(277B)
----.gitmodules(104B)
----README.md(3KB)
----.npmignore(0B)
----testRoundtrip.sh(222B)

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