文件名称：PySlide：组织病理学整个幻灯片图像预处理库
文件大小：3.59MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-13 01:10:58
JupyterNotebook
PySlide 正在开发中 很棒的组织病理学整个幻灯片图像处理库！ ·· 目录 关于该项目 该库提供了预处理组织病理学完整幻灯片图像的功能。 数字全片是物理组织标本的超高分辨率图像，在手术过程中已将其取出以供病理学家评估。 这些标本存储在载玻片上，并使用生物扫描仪进行扫描，以产生约100,000x100,000像素（1gb-4gb）大小的图像。 由于它们占用的内存很大，因此以计算方式分析图像可能是一项复杂的任务，尤其是在机器学习方面。 Openslide之类的库提供了一个不错的框架，可以像python这样的语言来打开和使用这些图像，但是缺少用于更高级的预处理和分析的丰富功能集。 该库是工作和操作WSI的综合框架的开始，尤其是侧重于机器学习。 例如，已经探索了许多方法来减轻训练ml全片图像数据集的内存负担，包括将图像平铺为更小，更易于管理的补丁。 该库提供了一种希望的简单方式来执行此类
【文件预览】：
PySlide-master
----14.90610 C L2.11.xml(800KB)
----images()
--------U_100188_10_X_HIGH_10_L1.xml(443KB)
--------14.90610 C L2.11.json(793KB)
--------48.90239 C L1.3.json(1.15MB)
--------logo.png(3KB)
--------32.90577 C 1 3 L2.3.json(1.03MB)
----14.90610 C L2.11.json(800KB)
----example.ipynb(1023KB)
----.gitignore(110B)
----pyslide()
--------save.py(5KB)
--------preprocessing.py(2KB)
--------utilities.py(2KB)
--------patching.py(6KB)
--------test.py(1KB)
--------__init__.py(147B)
--------measure.py(854B)
--------pyslide.py(6KB)
--------annotations.py(610B)
----README.md(7KB)
----masktest.png(18KB)
----test.png(2.52MB)