cell-segmentation

时间:2024-06-09 15:08:51
【文件属性】:

文件名称:cell-segmentation

文件大小:14.53MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-09 15:08:51

C

上皮细胞的两步分水岭分割 用法 将图像放入文件夹input_images中的HECD1,ACTIN,DAPI子文件夹中。 相应的图像应具有相同的名称。 修改parameters.R并双击“ Run_segmentation.bat”以运行分段。 然后,所产生的分段应出现在output_dir中。 然后双击“ Run_analyse.bat”以获得文件output_dir / data.txt,可以在Excel中打开该文件。 故障排除 错误:访问被拒绝 解决方案:如果您有防火墙,则可能阻止了程序的执行。 尝试禁用它。 如果确实存在防火墙,那么为R及其依赖项正确安装将是一个更安全的长期解决方案。 参考 Keraudren,K.,Spitaler,M.,Braga,VM,Rueckert,D.,&Pizarro,L .:在高通量RNAi筛选中分割上皮细胞,MIAAB 2011。


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