pset4

时间:2024-04-20 01:02:24
【文件属性】:

文件名称:pset4

文件大小:173KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-20 01:02:24

Python

概述 此存储库包含再现热图所需的所有代码和数据,该图概述了生物膜和持久性大肠杆菌MG 1655数据集(从两个不同的出版物中获得-参见下文)中常见检测到的蛋白质含量的倍数变化。 在此处查看项目背景: : 资料夹结构 码文件夹:包含Python和MATLAB代码,以生成用于生成两个数据集之间的蛋白质共同的表图proteomics_common_Ecoli.py Python代码并保存在持留和生物膜种群作为excel工作表中的数据文件夹中的倍数变化沿常见的蛋白质列表。 common_protein_heatmap.mat matlab代码,用于根据从proteomics_common_Ecoli.py python代码获得的数据生成热图。 数据文件夹:包含生成图形所需的已发布数据,请参见此README.md中的数据部分。 persister_biofilm_common.xls是从上述py


【文件预览】:
pset4-main
----.gitignore(0B)
----data()
--------common_protein_heatmap_MATLABdata.m(287B)
--------persister_TableS4.xls(50KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------iTRAQ_data_of_MG1655_Biofilm_Vs_Planktonic.xls(136KB)
--------persister_biofilm_common.xls(32KB)
----code()
--------common_protein_heatmap.mat(2KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------proteomics_common_Ecoli.py(2KB)
----.DS_Store(6KB)
----README.md(5KB)
----figures()
--------common_protein_heatmap.jpg(104KB)
--------common_protein_heatmap.fig(11KB)
----.gitattributes(0B)

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