文件名称：GenotypeBreakpoints:结构变异的基因型断点
文件大小：1.3MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-07 12:07:16
Java
CLOVE：将基因组融合分为结构变异事件 Clove是一个程序，用于对序列数据结构变异检测算法的输出进行后处理。 丁香扫描一组或多组融合调用的输出，以寻找复杂变异（例如平衡易位）的模式，并概括出融合调用。 丁香还使用从对齐文件中读取的深度信息来注释变体。
【文件预览】：
GenotypeBreakpoints-master
----.gitignore(11B)
----data()
--------simulated_chr12_1_simseq_s.bam_delly.bed(20KB)
--------results_Socrates_paired_simulated_chr12_1_simseq_s_long_sc_l25_q5_m5_i95.txt(43KB)
--------human_test_reads_s.bam.predSV.txt(73KB)
--------simulated_chr12_1.fa(11KB)
--------simulated_chr12_1_simseq_s.bam_delly.txt(94KB)
--------simulated_chr12_1_simseq_s.bam_delly.results(9KB)
--------simulated_chr12_2.fa(11KB)
----src()
--------GenomicNode.java(3KB)
--------META-INF()
--------Genotyper.java(64KB)
--------ComplexEvent.java(2KB)
--------GenomicCoordinate.java(991B)
--------Event.java(17KB)
----.classpath(294B)
----build()
--------classes()
--------fp_redundancy.py(837B)
--------compare_breakpoints.py(2KB)
--------fp_leniency.py(905B)
----LICENSE(1KB)
----Make.sh(106B)
----README.md(465B)
----.metadata()
--------.log(4KB)
--------.lock(0B)
--------version.ini(100B)
--------.plugins()
----.project(378B)
----lib()
--------htsjdk-1.122.jar(2.11MB)
--------sam-1.113.jar(716KB)
--------sam-1.77.jar(568KB)