dolphinnext:图形用户界面,用于高吞吐量基因组学的分布式数据处理

时间:2024-06-02 08:03:23
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文件名称:dolphinnext:图形用户界面,用于高吞吐量基因组学的分布式数据处理

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更新时间:2024-06-02 08:03:23

rna-seq pipeline nextflow drag pipelines

海豚下一个 创建可重现,便携式和高度并行管道的平台 引用:尤克瑟伦(Okselen,O.),图基尔马兹(Turkyilmaz,O.),厄兹特克(Ozturk),AR等。 DolphinNext:用于高通量基因组学的分布式数据处理平台。 BMC Genomics 21,310(2020)。 ,一个直观的Web界面,专为生物信息学经验有限的用户设计,可以在高性能计算(HPC)环境,云服务或个人工作站上分析和管理大量样本。 一个用于管理大型项目的处理管道的平台,该项目需要可扩展的解决方案并自动监视大量并发作业 拖放用户界面以创建NextFlow管道。 使用不同的执行程序(例如SGE,LSF,SLURM,Ignite等)运行管道。 设计的好处: 构建:使用拖放界面轻松创建新管道。 无需从头开始编写命令,而重用现有的进程/模块来创建新的管道 运行:在任何主机环境中执行管道。 无缝的Amaz


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