钻石

时间:2024-03-02 10:31:08
【文件属性】:

文件名称:钻石

文件大小:7KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-02 10:31:08

R

DIAMOND:16S扩增子和shot弹枪宏基因组分析 使用R(版本3.5.0和3.6.1)进行统计分析 PERMANOVA(纯素中的adonis函数,版本2.5.6,10,000个排列)用于量化协变量对观察到的微生物β多样性方差的贡献 MaAsLin2用于确定单个微生物分类之间的关联,这些分类存在于≥10%的样本中 未配对的Wilcoxon(rstatix,版本0.3.0)和Kruskal-Wallis检验分别用于比较两个独立小组和> 2个独立小组。 卡方独立性检验和Fisher精确检验用于确定两个类别变量之间的关联 使用Benjamini-Hochberg程序对所有q值(经FDR校正的p值)进行了多次测试的校正


【文件预览】:
DIAMOND-master
----DIAMOND_script.R(59KB)
----.gitignore(570B)
----README.md(808B)

网友评论