biosample_metadata:从NCBI中的生物样品中提取元数据

时间:2024-04-28 18:31:54
【文件属性】:

文件名称:biosample_metadata:从NCBI中的生物样品中提取元数据

文件大小:3KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-28 18:31:54

biosample_metadata 该工具支持将BioSample元数据提取到用户友好表中。 假设您将提供有效的BioSamples列表并写出表格。 如果提供了现有表,它将用于使用提供或添加的样本集合中存在的其他列来更新该表。 用法 biosample2table [ --in sample_list.txt] [--sample sampleid sampleid2 ...] --out result_table.tsv [--update] 争论 描述 -o /-出 将表写出到该文件(如果该文件已存在),将其解析并重用现有数据,然后添加到该文件中。 将使用文件扩展名(.tab / .tsv或.csv)确定输出格式(如果扩展名不匹配,则默认为制表符分隔的格式)。 如果省略--out ,将写入STDOUT(但是当然将无法使用以前缓存的结果) - 更新 使用现有表获取样本ID,还可


【文件预览】:
biosample_metadata-main
----LICENSE(1KB)
----README.md(1KB)
----.gitignore(2KB)

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