keggannot:KEGG注释Python库

时间:2024-05-21 06:35:20
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文件名称:keggannot:KEGG注释Python库

文件大小:756KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-21 06:35:20

Python

打包以基于blastp对KEGG数据库注释蛋白质。 关于KEGG版本和支持的注意事项 该软件已经过2013年4月版KEGG数据库的测试。 如果不更改代码,则不能使用任何其他版本的KEGG。 该软件也按原样提供,很可能不会收到任何进一步的更新。 安装 python setup.py install 用法 usage: keggannot_genes2ko [-h] [-v] [-V] [-m] [kegg_dir] [blast_file] Annotate proteins with KEGG BLAST results positional arguments: kegg_dir KEGG data directory (default: None) blast_file Tabular blast results file (default: None)


【文件预览】:
keggannot-master
----bin()
--------keggannot_genes2ko(3KB)
----keggannot()
--------__init__.py(51B)
--------annot.py(16KB)
--------_version.py(80B)
----test()
--------test_output.tsv(24KB)
--------test100.fasta.gz(29KB)
--------test.txt(548B)
--------test_output-m.tsv(18KB)
--------test100.blast7.tsv.gz(704KB)
----LICENSE(10KB)
----setup.py(754B)
----.gitignore(28B)
----README.md(2KB)

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