从 Gromacs TPR 文件中提取 PDB：从 Gromacs TPR 文件中提取结构数据并将其输出为 PDB 格式。-matlab开发

【文件属性】：

文件名称：从 Gromacs TPR 文件中提取 PDB：从 Gromacs TPR 文件中提取结构数据并将其输出为 PDB 格式。-matlab开发

文件大小：4KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-06-19 07:55:18

matlab

%% TPR2PDB.m % % Gromacs 对于模拟全原子系统很有用，它启动了这些% 使用 TPR 文件进行模拟。 所有 TPR 文件都包含坐标数据% 启动模拟。 有时打开并检查它是有用的％ 结构体。 该程序提取它并将其转换为 PDB 格式以供% 方便查看。 提取的信息是坐标、原子类型、 % 和部分费用。 部分费用存储在 beta-factor 列中% 的输出文件。 % % ％ - - - 要求 - - - % % GROMACS % 这个程序使用 Gromacs 命令“GMXdump”来创建一个文本％ 文件。 这避免了 Gromacs 可能出现的任何问题% 更新和版本更改。 确保此命令有效％ 小路。 % % gmxdump ％ 看上面。 启动这个文件的命令是% $> gmxdump -s [TPR 文件] > textForAnalysis.txt % 如果这不能正确完成，

【文件预览】：
TPR2PDB.zip