文件名称：将 Gromacs v 4.5 轨迹文件转换为 MatLab 矩阵：在 matlab 中将 Gromacs 轨迹文件 (.trr) 转换为 3D 矩阵。-matlab开发
文件大小：421KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-19 06:32:29
matlab
% trr2matlab.m 作者：Evan Arthur，密歇根大学，2011 年 10 月Matlab以相对一致的格式输出轨迹，即从根本上讲，Matlab 直接读取具有挑战性且效率低下。 该程序从最新版本的 Gromacs 翻译大多数 trr 文件转换成可以快速有效地读入 Matlab 的二进制文件通过 readGmx2Matlab.m。 readGmx2Matlab.m 是读取输出的兄弟程序这个程序。 目前只有坐标、速度和力输出。 如果我收到对其他输出的请求（框尺寸、lambda 参数等）我会适应它。 要求： - Gromacs trr 轨迹文件（GMX trn 格式） 在 4.5 及更高版本上测试-readGmx2Matlab.m（读取此脚本的输出） - 可用内存：不多。 大多数模拟小于 500 kb。 - 可用硬盘：您输入的 .trr 的 1 到 2 倍。 默认情况下，整个轨迹
【文件预览】：
Gmx2Matlab_v1.7.zip
Gmx2Matlab_v1.6.zip