文件名称:epitools-icy:适用于生物成像平台的EpiTools插件
文件大小:238KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-18 14:08:19
Java
欢迎使用CellGraph(EpiTools的又名icy插件) CellGraph是用于生物成像框架的插件集合,可将骨架图像转换为交互式叠加层以浏览和分析您的数据(示例)。 CellGraph是EpiTools项目的一部分,EpiTools项目是一个用于量化上皮生长动力学的开源图像分析工具包。 要了解有关该项目的更多信息,请访问我们的项目网站或相关代码库: EpiTools主页: ://epitools.github.io 图像处理部分(MATLAB): : 如果您喜欢CellGraph并在工作中使用它,请引用我们在《发展细胞》(2016年1月)中的EpiTools论文,该论文可从免费获得。 插件细分 插件涵盖了分析的后续步骤: 从输入骨架文件开始生成时空图 使用户可以在剩余分割错误的情况下手动交互式地修改骨架图像 解释数据并以图形叠加层(即附加图像层)和表格文件的形式输出结