chiadrop:用于ChIA-drop数据分析的脚本

时间:2024-04-30 10:30:52
【文件属性】:

文件名称:chiadrop:用于ChIA-drop数据分析的脚本

文件大小:5KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-30 10:30:52

R

ChIA-drop-具有单分子精度的多重染色质相互作用 带有免疫抑制的ChIA-Drop数据分析代码(例如CTCF或H3K4me1)。 它处理FASTQ数据并创建一个多接触列表,以单分子分辨率表示染色质相互作用。


【文件预览】:
chiadrop-main
----Mus_musculus.GRCm38.dna.primary_assembly.fa.fai(2KB)
----03_processBED.sh(21B)
----fastqToGEMlibrary.R(1KB)
----processBED.R(1KB)
----README.md(300B)
----02_ReadAlignment.sh(2KB)
----HEADER_miaSig.txt(77B)
----01_fastqToGEMlibrary.sh(144B)
----04_getMultiContacts.r(80B)

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