hh-suite：远程蛋白质同源性检测套件

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文件名称：hh-suite：远程蛋白质同源性检测套件
文件大小：6.74MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-01 01:35:50
opensource bioinformatics cpp protein-structure simd HH-suite3用于敏感序列搜索 （C）约翰内斯·索丁，马库斯·迈耶，马丁·斯坦纳格，米洛·米尔迪塔，迈克尔·雷默特，安德里亚斯·豪瑟，安德里亚斯·比格特 HH-suite是一个开放源代码软件包，用于基于隐马尔可夫模型（HMM）的成对比对进行敏感蛋白质序列搜索。 文献资料 我们提供了一个详尽的，其中包含许多用法示例，常见问题解答和用于构建自己的数据库的指南。 安装 还可以通过下载静态编译的版本或来安装HH-suite3。 HH-suite3需要64位系统（使用uname -a | grep x86_64检查）。 在AMD / Intel CPU上，它至少需要支持SSE2指令集（通过在Linux上执行cat /proc/cpuinfo | grep sse2或在macOS上执行sysctl -a | grep machdep.cpu.features | grep SSE2进行检查）。 与SSE2相比， AVX2速度大约快2倍。 HH-suite3还可以在具有ARM64和PPC64LE CPULinux系统上使用。 可在找到所有受支持系统的预编译二进制文件。 # install v