Genrich:检测基因组富集的位点

时间:2024-05-24 23:40:47
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文件名称:Genrich:检测基因组富集的位点

文件大小:111KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-24 23:40:47

C

Genrich:检测基因组富集的位点 目录 I / O文件和选项 所需文件 可选文件 筛选选项未配对的比对 ATAC序列模式 调峰参数 各种各样的 完整的分析示例 警告讯息 计算要求 接触 介绍 Genrich是基因组富集测定(例如ChIP-seq,ATAC-seq)的高峰调用者。 它分析测定后生成的比对文件,并生成详细说明显着富集峰的文件。 快速开始 鉴于: sample.bam (对齐文件,按查询名称排序) Genrich (编译为描述如下) 要生成列出基因组富集区域的文件,请执行以下操作: $ ./Genrich -t sample.bam -o sample.narrowPeak -v 软件编译 该软件可以从GitHub下载。 提供了一个Makefile以便使用GCC进行编译,并且还需要zlib 。 使用GCC 5.4.0和zlib 1.2.8编译后,该程序已


【文件预览】:
Genrich-master
----.gitignore(8B)
----findNs.py(3KB)
----Makefile(87B)
----LICENSE(1KB)
----README.md(39KB)
----Genrich.h(9KB)
----Genrich.c(171KB)
----figures()
--------figure2.png(14KB)
--------figure1.png(34KB)
--------figure3.png(16KB)

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