文件名称：pathogen-informatics-training
文件大小：423.47MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-18 18:52:45
bioinformatics research genomics pathogen sequencing
病原体信息学培训 由 Wellcome Sanger Institute 的 Pathogen Informatics 开发的一套生物信息学培训课程。 内容 介绍 这些生物信息学培训课程使用 Jupyter 笔记本来提供病原体信息学培训，并且可以使用以下笔记本： 用于生物信息学的 UNIX BLAST 简介 NGS 数据格式和 QC IGV 简介 RNA-Seq 表达分析 使用 DEAGO 进行差异表达和 GO 术语分析 使用 Roary 构建泛基因组 使用 ARIBA 进行抗菌素耐药性鉴定 使用 SeroBA 进行血清型检测 路径查找 (pf) 脚本 芯片序列 LSF 安装 课程使用 notebook，这意味着必须安装 Jupyter 才能使用它们。 有关详细信息，请参阅。 如果您在 MacOS 上运行 Jupyter，则可能必须安装 bash 内核。 为此，请运行以下命令：