cwl:Pitagora-Network提供的通用工作流语言工具和工作流

时间:2024-05-27 07:29:01
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文件名称:cwl:Pitagora-Network提供的通用工作流语言工具和工作流

文件大小:304KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-27 07:29:01

CommonWorkflowLanguage

CWL中的Pitagora工作流程 该存储库将共享由Pitagora Network(称为Galaxy Community Japan)维护的工具和工作流程的定义文件。 工具 获取数据 资料格式 读取对齐 变异分析 皮卡德 转录组分析 剪接点映射器tophat2 成绩单组装/量化 袖扣 扎带 表示 rsem 重新读取 卡利斯托 旗鱼 三文鱼 从头转录组组装三位一体 工作流程 有关说明,请参见每个工作流程目录中的文档。 RNA序列 TopHat2- * tophat2-袖扣 HISAT2- * hisat2袖扣 hisat2扎带 星星-* 明星袖扣 星型领带 卡利斯托 三文鱼 测试 上面列出的每个工作流程都有一个Shell脚本来运行该工作流程进行测试。 有关如何执行测试运行的信息,请参见每个工作流目录中的自述文件。 与工作流程捆绑在一起的测试脚本将自动下载下面列出的相


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