文件名称：Genome Profiler:用于细菌 WGS 数据的 wgMLST 分析工具-开源
文件大小：243KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-18 13:11:39
开源软件
Genome Profiler (GeP) 是一个对细菌分离株进行全基因组多位点序列分型 (wgMLST) 分析的程序。 请注意，该程序旨在运行在类 Unix 操作系统中，例如 Mac OS X 或 Linux。 GeP 使用保守基因邻域 (CGN) 来解决基因并行。 这种方法允许将直向同源物与最近复制的旁系同源物区分开来，这些平行同源物通常无法通过成对序列比对来区分。 有关更多详细信息，请参阅我们的出版物：http://jcm.asm.org/content/53/5/1765.abstract 2018 年 9 月 11 日更新：该项目将在 Sourceforge 停止更新。 请从以下位置下载最新版本：https://github.com/jizhang-nz 2017 年 10 月 4 日更新：版本：2.1 错误已修复。 2015 年 9 月 8 日更新：当使用等位基因序列 (nt) 的多 Fasta 文件作为参考（开关 -n）时，请仅使用大写字母 A、T、G 和 C 作为序列。 此错误将在下一个版本中修复。