文件名称：Chromatin-Fiber-Imaging:染色质纤维成像
文件大小：31KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-22 11:10:56
Python
染色质纤维成像 介绍 该工具的主要目的是从单分子定位显微镜（SMLM）数据自动检测具有用户定义大小的分子簇，并提供XY，YZ和XZ投影以供观察和进一步过滤以供专家使用。 还提供了用于参考相应的统计信息，如X和Y尺寸，Z的长度，平均的定位精度，平均光子计数，位置，最大帧间隙等的FWHM我们也建议使用web服务器版本 相依性 脾气暴躁的 大熊猫 的OpenCVPython的 LMFIT matplotlib 建议通过enviroment.yml通过conda环境建立运行环境。 用法 输入数据 输入的是SMLM数据，应为CSV格式。 每条线代表一个局部化的单分子。 这些列应包含： 栏名 描述 X 单分子质心x轴的像素坐标。 ÿ 单分子质心y轴的像素坐标。 ž 单分子质心的z轴的像素坐标。 X拟合误差 局部单分子的X拟合误差。 Y拟合误差 局部单分子的Y拟合误差。 照相计数
【文件预览】：
Chromatin-Fiber-Imaging-main
----.gitignore(87B)
----src()
--------seg.py(3KB)
--------findFiber.py(38KB)
--------loadData.py(7KB)
--------SMLMAnalyzer.py(4KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(5KB)
----environment.yml(5KB)