文件名称：pia:PIA-蛋白质推断算法
文件大小：25.19MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-14 18:06:40
search-engine inference protein proteomics protein-inference
PIA-蛋白质推断算法 PIA是用于基于MS的蛋白质推断和鉴定分析的工具箱。 PIA允许您检查常见蛋白质组学谱识别搜索引擎的结果，将它们无缝组合并进行统计分析。 PIA的主要重点在于集成的推理算法，即从一组已识别的光谱中得出蛋白质。 但是，它也使您可以检查肽段谱图的匹配情况，计算不同搜索引擎结果中的FDR值并可视化PSM，肽段和蛋白质之间的对应关系。 简而言之，PIA 尽管实际搜索会产生一组肽谱匹配（PSM），但大多数用于MS / MS实验中蛋白质鉴定的搜索引擎都会返回蛋白质列表。 从PSM到蛋白质的步骤称为“蛋白质推断”。 如果一组已识别的PSM支持在搜索的数据库中检测到一个以上的蛋白质（“蛋白质歧义性”），通常仅报告一个代表性的登录。 根据使用的搜索引擎和设置，这些代表可能有所不同。 因此，不同搜索引擎的蛋白质列表通常无法相互比较。 互补搜索引擎的PSM通常被组合使用，以增加报告的