3D blob 分割:3D blob 分割-matlab开发

时间:2024-06-18 08:43:05
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文件名称:3D blob 分割:3D blob 分割-matlab开发

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更新时间:2024-06-18 08:43:05

matlab

该算法使用图像导数来分割密集的 3D 组织中的细胞核。 输入文件是一组以 tiff 或 lsm 格式(来自卡尔蔡司显微镜)存储的随时间成像的 z 切片。 在基于图像导数的第一级分割之后,计算 3D 属性。 使用这些属性为分割对象推断图像统计数据,并且该算法实施聚类方法(请注意,计算时间很长!!)将融合的原子核解析为单个原子核。 有关更多详细信息,请阅读“ 3D胚胎成像中的对象分割和地面真相”已发表的研究文章(PLOS ONE | DOI:10.1371 / journal.pone.0150853)。 请参考这篇作品的引用。


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3Dnucleisegmentation.zip

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