文件名称：ART-DeCo:ART-DeCo使用多态性等位基因比率预测污染-开源
文件大小：48KB
文件格式：XLSX
更新时间：2024-06-15 19:54:20
开源软件
ART-DeCo（基于等位基因比率的污染检测工具）已被设计用于在NGS体质分析中检测污染。 该工具使用在目标区域内测序的单核苷酸多态性（SNP）的等位基因比率（AR）。 当样品被具有不同基因型的DNA污染时，会获得意外的AR。 依次将其用于通过筛选测试检测污染物，然后进行污染物的鉴定和定量。 从基因组到全基因组分析，ART-DeCo均可在任何NGS工作流程中实施。 任何多态性都是有帮助的。 应考虑连锁不平衡中的稀有SNP和SNP，以合并预计的污染。