文件名称:rosalind:罗莎琳德问题
文件大小:85KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-04 16:47:32
Python
罗萨林德 罗莎琳德问题的解决方案( ) 储存库结构 每个问题的代码位于src文件夹中。 相应的数据在data文件夹中。 每个解决方案及其相关数据均以Rosalind上给出的问题ID命名: src/{ID}.py data/{ID}.txt 运行代码 克隆此存储库,创建虚拟环境并安装依赖项。 git clone git@github.com:LoicGoulefert/rosalind.git cd rosalind python3.7 -m venv venv source venv/bin/activate pip install -U pip pip install -r requirements.txt 运行解决方案: python src/GC.py
【文件预览】:
rosalind-main
----.gitignore(26B)
----requirements.txt(269B)
----data()
--------REVP.txt(891B)
--------SSEQ.txt(988B)
--------MPRT.txt(154B)
--------SUBS.txt(956B)
--------DNA.txt(926B)
--------PROT.txt(8KB)
--------RNA.txt(963B)
--------GRPH.txt(10KB)
--------LGIS.txt(43KB)
--------FIB.txt(4B)
--------LCSQ.txt(2KB)
--------PERM.txt(1B)
--------HAMM.txt(2KB)
--------SPLC.txt(2KB)
--------monoisotopic-mass-table.txt(274B)
--------IEV.txt(35B)
--------MRNA.txt(997B)
--------REVC.txt(882B)
--------PRTM.txt(904B)
--------IPRB.txt(8B)
--------RNA_codon_table.txt(393B)
--------CONS.txt(10KB)
--------LCSM.txt(101KB)
--------GC.txt(7KB)
----src()
--------MPRT.py(1KB)
--------SPLC.py(1KB)
--------REVP.py(1018B)
--------SSEQ.py(979B)
--------PRTM.py(950B)
--------PERM.py(273B)
--------GRPH.py(1013B)
--------DNA.py(228B)
--------LCSQ.py(1KB)
--------LGIS.py(1KB)
--------PROT.py(326B)
--------CONS.py(1KB)
--------MRNA.py(886B)
--------LCSM.py(1KB)
--------REVC.py(189B)
--------utils.py(3KB)
--------SUBS.py(597B)
--------GC.py(730B)
--------IPRB.py(786B)
--------RNA.py(115B)
--------FIB.py(351B)
--------HAMM.py(594B)
--------IEV.py(871B)
----README.md(641B)