文件名称：Imaging-utils：杂项分析和帮助程序脚本
文件大小：975KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-09 22:43:52
JupyterNotebook
成像工具 Suite2p帮助程序脚本 脚本旨在提供一种简单的方法来在文件夹上运行工具包，并以IgorPro友好格式（ hdf5 ）从.npy生成的numpy二进制文件（ .npy ）重新打包分析结果。 当前，该脚本适用于双极性数据的使用，因此，为简单起见，目前可配置性受到限制。 功能和可配置性将根据需要随时间扩展。 设置 按照找到的suite2p安装说明进行操作 在设置suite2p时创建的suite2p conda环境中，请确保已安装s2p_runner.py所需的其他库，如下所示： conda install scikit-image pillow 用法（s2p_runner.py） 从包含您要从中提取ROI的s2p_runner.py的目录中运行脚本s2p_runner.py ，该目录可能类似于以下内容： Windows： C:\path\to\tiffs> python C:\
【文件预览】：
imaging-utils-main
----.gitignore(2KB)
----exploratory.ipynb(734KB)
----s2p_packer.py(6KB)
----README.md(4KB)
----image_arrays.py(14KB)
----extra_analyis.py(460B)
----s2p_runner.py(3KB)
----noise_analysis.ipynb(1.07MB)