文件名称:genomics-workspace:通用序列搜索工具的Django网站项目
文件大小:26.14MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-20 20:27:02
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基因组工作区 Genomics-Workspace是创建的生物信息学网站项目。 它提供了常见的序列搜索服务,包括 , 和 。 要查看实际效果,请访问以下实时网站: 高炉: : HMMER: ://i5k.nal.usda.gov/webapp/hmmer/ 集群: : 特征 后端 使用Django在Python中实现。 支持搜索BLAST , HMMER和Clustal 。 Celery和RabbitMQ的任务队列。 使用PostgreSQL作为数据库后端。 爆破: 生成几种供下载的BLAST输出格式:文本,TSV,XML,ASN.1。 通过将具有相同查询序列,主题序列,链方向以及在相同匹配下相邻HSP之间的重叠长度小于6的连续HSP分组,将BLAST输出转换为GFF3。 使用每个任务的唯一URL检索以前的结果。 同时支持Linux和MacOS。 前端 由