seqalign:序列比对算法的集合

时间:2024-06-05 18:06:40
【文件属性】:

文件名称:seqalign:序列比对算法的集合

文件大小:90KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-05 18:06:40

smith-waterman needleman-wunsch string-distance hacktoberfest sequence-alignment

序列对齐 序列比对算法的集合。 目录 入门 从npm安装软件包: $ npm install --save seqalign 将包导入到您的项目中: const { NWaligner , SWaligner } = require ( 'seqalign' ) ; 对准器 SWaligner和NWaligner是出厂功能,您可以创建许多具有不同参数的SWaligner , NWaligner将其重复使用多次。 可以使用以下参数来配置对齐器(所有这些参数都是可选的): similarityScoreFunction :以两个字符(字符串)作为输入,并返回相似度得分(整数)。 gapScoreFunction : Smith-Waterman:将一个正整数作为输入(间隙长度)并返回一个分数(整数)。 Needleman-Wunsch:不输入任何内容,并返回恒定分数,用于对比对


【文件预览】:
seqalign-master
----.gitignore(927B)
----.eslintrc(256B)
----package.json(1KB)
----src()
--------dtypes.js(489B)
--------utils.spec.js(2KB)
--------aligner.factory.spec.js(552B)
--------matrix.utils.js(2KB)
--------nw.algorithm.js(2KB)
--------traceback.js(1KB)
--------index.js(674B)
--------aligner.factory.js(1KB)
--------utils.js(800B)
--------traceback.utils.js(770B)
--------sw.algorithm.js(4KB)
--------matrix.utils.spec.js(4KB)
--------index.spec.js(6KB)
--------dtypes.spec.js(1KB)
----.travis.yml(1KB)
----LICENSE(1KB)
----CHANGELOG.md(772B)
----README.md(4KB)
----.prettierrc(143B)
----yarn.lock(189KB)

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