文件名称：Catrex GUI：图形用户界面，可从成像实验中提取钙瞬变。 从原始 tiff 文件中获取神经元活动的光栅。-matlab开发
文件大小：426KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 19:04:50
matlab
MATLAB中的GUI，用于从成像实验中自动提取钙瞬变。 1.将获取的图像序列加载到tiff文件中。 2. 执行非刚性（或刚性）运动校正。 3. 基于 Suite2P 算法查找单元格（Pachitariu 等，2016）。 4. 评估确定的 ROI（面积、圆度、周长、偏心率和重叠）。 5.使用局部Neuropil作为荧光的基础提取钙瞬变。 6.评估峰值信噪比（PSNR）。 7. 执行尖峰推断 (foopsi; Friedrich & Paninski, 2016)。 8. 获取栅格活动，一个二进制矩阵，其中每一行是单个 ROI 的活动。 输出分析了所有数据的结构变量
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