文件名称:Just_Preprocess_My_Reads-开源
文件大小:26.1MB
文件格式:GZ
更新时间:2024-05-18 13:13:17
开源软件
以标准方式识别rRNA,污染物,修饰等。保持读取对。 专为一劳永逸的高吞吐量项目(兆兆字节数据)而设计。 使用pbzip2,bowtie2,fastx_toolkit,samtools,fastqc,Trimmomatic(可选)
【文件预览】:
justpreprocessmyreads-code
----.project(373B)
----rename_SRA_sra_fastq.pl(1KB)
----preprocess_illumina_automatic.pl(630B)
----3rd_party()
--------fastqc_v0.11.3.zip(9.56MB)
--------allpaths.zip(14.74MB)
--------Trimmomatic-0.33.zip(121KB)
----LICENSE(11KB)
----test()
--------test1.fastq.bz2(937KB)
--------cleanme.sh(73B)
--------runme.sh(568B)
--------test2.fastq.bz2(930KB)
----preprocess_illumina.pl(23KB)
----README.md(1KB)
----Makefile(986B)
----dbs()
--------illumina_PE_2008_adapters.fsa(4KB)
----docs()
--------index.html(19KB)
--------index.asciidoc(1KB)