文件名称:java3d源码-gdsc-smlm:GDSC单分子光学显微镜ImageJ插件
文件大小:5.77MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-24 09:38:47
系统开源
java3d源码GDSC 单分子光学显微镜 (SMLM) ImageJ 插件 GDSC 单分子光学显微镜 (SMLM) 插件为单分子定位分析提供了各种工具。 这包括 PALM、STORM 和其他单分子显微镜方法。 这些插件提供了以下工具: 使用 2D 高斯点扩展函数 (PSF) 拟合图像或一系列图像 将结果保存到表格、文件、图像和/或内存中 通过时间跟踪或聚类定位以识别分子 纠正长时间课程图像中的漂移 估计荧光团暗时间和闪烁率 创建定位密度图像 从校准图像创建自定义 PSF 使用具有可配置分子种群和扩散的高斯或自定义 PSF 创建模拟数据 校准显微镜相机的增益和读取噪声 估计图像中的噪声 使用傅立叶环相关估计分辨率 可以从文件中加载结果以使用以下格式进行分析: SMLM 文本/二进制 快速风暴 尼康暴风雪 文档 请参阅 上的最新文档。 安装 SMLM 插件使用 ImageJ2/Fiji 更新站点分发。 要使用 Fiji(ImageJ 发行版)安装插件,只需按照说明操作并添加 GDSC SMLM 更新站点。 所有插件都将出现在“插件 > GDSC SMLM”菜单下。 从源安装 源代码使用