文件名称:matlab导入excel代码-Colocalization_Object_Counter:ImageJ/FIJI插件
文件大小:996KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-10 03:26:21
系统开源
matlab导入excel代码共定位对象计数器 一个ImageJ插件,用于逐个单元的半自动基于对象的共定位分析 重要连结 链接至《科学报告》的论文: 视频说明(插件1): 视频说明(插件2 + Excel + Matlab): 特征: ImageJ插件1:共定位图像创建者: *将多通道Z-stack(或2D)显微镜图像预处理为可视格式,以便更快,更简单,更准确地进行共定位分析。 *旨在帮助避免常见的共定位分析工件和错误。 *可以将Z-stack 3D数据转换为专用的2D Z投影,其中可以删除/减少Z投影的共定位伪像。 这简化了3D共定位数据的分析。 *取决于组织感兴趣细胞的密度,用于组织切片的深度较深。 在使用此工具进行分析之前,最好将较厚的3D扫描细分为子堆栈(内置ImageJ子堆栈工具)。 ImageJ插件2:Colocalization对象计数器: *数量(计数)单元格/对象以半自动方式。 *为每个单元/对象分配,分类和跟踪多通道信号的存在/不存在(共定位分析)。 *用于后续3D建模/数据表示的工具:绘制组织轮廓并指示图像系列的全局XY起源。 *保存数据,加载数据并将数据导出到E
【文件预览】:
Colocalization_Object_Counter-master
----.gitignore(49B)
----src()
--------main()
----Matlab 3d visualization files()
--------colors.txt(6KB)
--------Colocalization_Visualization_3D_GUI.m(8KB)
--------Colocalization_Visualization_3D_non_GUI.m(4KB)
--------Colocalization_Visualization_3D_GUI.fig(35KB)
----Excel data organizer macro file()
--------ColocalizationObjectCounter_Importer.xlsm(957KB)
----LICENSE(34KB)
----pom.xml(3KB)
----README.md(11KB)
----Colocalization Object Counter menu.png(27KB)
----jar-file()
--------Colocalization_Object_Counter-1.0.0.jar(271KB)
----Plugin overview.png(246KB)