文件名称：MDAPackmol:Packmol周围的MDAnalysis包装器
文件大小：17KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-17 08:24:01
Python
丙二醛 一个围绕包装 允许结合使用MDAnalysis和Packmol Packmol之后保留系统的拓扑信息（键等） 免费软件：GNU通用公共许可证v3 使用范例 import MDAnalysis as mda import mdapackmol # load individual molecule files water = mda . Universe ( 'water.pdb' ) urea = mda . Universe ( 'urea.pdb' ) # call Packmol with MDAnalysis objects as arguments # the 'instructions' allow for any valid Packmol commands system = mdapackmol . packmol ( [ mdapackmol . P
【文件预览】：
MDAPackmol-master
----setup.py(1KB)
----.gitignore(136B)
----Makefile(2KB)
----mdapackmol()
--------__init__.py(260B)
--------tools.py(2KB)
--------mdapackmol.py(8KB)
----.travis.yml(402B)
----MANIFEST.in(217B)
----LICENSE(2KB)
----setup.cfg(453B)
----.github()
--------ISSUE_TEMPLATE.md(322B)
----README.rst(2KB)
----.coveralls.yml(70B)
----tests()
--------urea.pdb(447B)
--------test_mdapackmol.py(3KB)
--------water.pdb(255B)
----AUTHORS.rst(166B)
----docs()
--------Makefile(611B)
--------index.rst(308B)
--------conf.py(5KB)
--------history.rst(28B)
--------authors.rst(28B)
--------installation.rst(1KB)
--------make.bat(772B)
--------readme.rst(27B)
--------usage.rst(76B)
--------contributing.rst(33B)
----.editorconfig(292B)