score_mip_variants:[MIP](http

时间:2024-07-22 08:20:34
【文件属性】:

文件名称:score_mip_variants:[MIP](http

文件大小:39KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-22 08:20:34

Python

#Score Mip 变体# 一个简单的工具,用于为 VCF 中的所有变体添加排名分数并使用它们的组合排名分数注释化合物。 变体应使用 vep、snpeff 和 genmod 进行注释以获得最佳结果。 ###用法### score_mip_variants examples/my_test.vcf examples/trio_ped.txt --plugin_file test.ini


【文件预览】:
score_mip_variants-master
----MANIFEST.in(90B)
----LICENSE.txt(1KB)
----scripts()
--------score_mip_variants(8KB)
----examples()
--------my_test.vcf(36KB)
--------test.ini(6KB)
--------full_score.vcf(32KB)
--------trio_ped.txt(638B)
----setup.cfg(39B)
----score_mip_variants()
--------plugin_rank_model_cmms.py(14KB)
--------variant_scorer.py(7KB)
--------configs()
--------variant_sorter.py(7KB)
--------score_model.py(15KB)
--------__init__.py(0B)
--------plugin_reader.py(4KB)
----setup.py(2KB)
----README.md(312B)
----.gitignore(101B)

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