【文件属性】：
文件名称：患者预处理：用于神经影像数据的各种预处理操作（注册，切片，去噪，分割等）的MATLAB代码
文件大小：43KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-24 12:59:53
MATLAB
患者预处理
这是用于各种神经成像预处理操作（注册，切片，去噪，分割等）的MATLAB代码，其最初旨在处理常规临床数据（因此得名）[1]。 它以nifti文件（如.nii或.nii.gz）作为输入，并生成此数据的副本，并对其应用了所需的预处理步骤。 它还使用成对的标签遮罩（例如T1w MRI和肿瘤遮罩（或多个类别））处理图像数据，并确保生成的预处理数据是一致的。 请参阅下面的示例用例，这些用例可以独立运行，也可以启发更复杂的预处理任务。
依存关系
该算法要求以下软件包位于MATLAB路径上：
SPM12：从下载。
spm_superres：从下载/克隆（如果要使用降噪或超分辨率选项）。
用例范例
1.多通道MRI分割
该MATLAB代码段将多个序列的MR图像作为输入，并生成已被共同注册和切片的图像。 然后使用SPM12统一分段例程对这些图像进行分段，并将本机+模板（未调制）空间GM，WM
【文件预览】：
Patient-Preprocessing-master
----RunPreproc.m(9KB)
----private()
--------make_normalised.m(7KB)
--------nm_reorient_ims.m(344B)
--------reslice_images.m(903B)
--------brute_mni_align.m(4KB)
--------write_nii.m(673B)
--------reslice2template.m(2KB)
--------intensity_normalise.m(359B)
--------crop.m(3KB)
--------resample_images.m(2KB)
--------realign2mni.m(3KB)
--------read_data.m(753B)
--------subvol.m(1KB)
--------denoise.m(1KB)
--------coreg.m(1KB)
--------reslice_labels.m(2KB)
--------skull_strip.m(2KB)
--------bf_correct.m(285B)
--------reset_origin.m(2KB)
--------segment_preproc8.m(4KB)
--------apply_bb.m(2KB)
--------collapse_labels.m(1KB)
--------get_default_opt.m(5KB)
--------nm_reorient.m(3KB)
--------write_2d.m(4KB)
--------superres.m(2KB)
--------read_and_copy.m(3KB)
--------erode_im.m(567B)
--------run_reslice.m(732B)
----LICENSE(34KB)
----.gitignore(736B)
----README.md(6KB)