GNR-DNA:DNA序列的图形和数字表示

时间:2024-03-30 12:21:15
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文件名称:GNR-DNA:DNA序列的图形和数字表示

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更新时间:2024-03-30 12:21:15

bioinformatics dna biological-sequences rna-sequences R

核糖核酸 DNA序列的图形和数字表示 R库,用于以图形和数字方式表征生物序列。 如果您想了解实施方法的要点,请阅读以下文章 DNA序列结构的新图形表示和分析:1.球蛋白基因的方法和应用,Curr Sci 66:309-314 安装 为了安装和加载软件包,请在R控制台中运行以下代码 library( devtools ) install_github( ' officialprofile/GNR-DNA ' ) library( drep ) 如何使用它 在大多数情况下,一行代码可以产生令人满意的结果。 例如 plot2DGraph(c( ' KX369547 ' , ' HQ234498 ' ), genbank = TRUE , main = ' Comparison of two sequences ' ) 返回ZIKV基因组的现成图 plot2DGraph(c( ' KX36954


【文件预览】:
GNR-DNA-main
----man()
--------dRep.Rd(879B)
--------drepMultiple.Rd(492B)
--------plot2DGraph.Rd(261B)
--------dGraph.Rd(573B)
----README.md(2KB)
----drep.Rproj(417B)
----DESCRIPTION(314B)
----R()
--------setVectors.R(1012B)
--------dRep.R(5KB)
--------drepMultiple.R(443B)
--------plot2DGraph.R(1KB)
--------dGraph.R(1KB)
----img()
--------example1.png(117KB)
--------example2.png(154KB)
----NAMESPACE(30B)

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