【文件属性】:
文件名称:GNR-DNA:DNA序列的图形和数字表示
文件大小:276KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-10 18:34:35
bioinformatics dna biological-sequences rna-sequences R
核糖核酸
DNA序列的图形和数字表示
R库,用于以图形和数字方式表征生物序列。 如果您想了解实施方法的要点,请阅读以下文章
DNA序列结构的新图形表示和分析:1.球蛋白基因的方法和应用,Curr Sci 66:309-314
安装
为了安装和加载软件包,请在R控制台中运行以下代码
library( devtools )
install_github( ' officialprofile/GNR-DNA ' )
library( drep )
如何使用它
在大多数情况下,一行代码可以产生令人满意的结果。 例如
plot2DGraph(c( ' KX369547 ' , ' HQ234498 ' ), genbank = TRUE , main = ' Comparison of two sequences ' )
返回ZIKV基因组的现成图
plot2DGraph(c( ' KX36954
【文件预览】:
GNR-DNA-main
----man()
--------dRep.Rd(879B)
--------drepMultiple.Rd(492B)
--------plot2DGraph.Rd(261B)
--------dGraph.Rd(573B)
----README.md(2KB)
----drep.Rproj(417B)
----DESCRIPTION(314B)
----R()
--------setVectors.R(1012B)
--------dRep.R(5KB)
--------drepMultiple.R(443B)
--------plot2DGraph.R(1KB)
--------dGraph.R(1KB)
----img()
--------example1.png(117KB)
--------example2.png(154KB)
----NAMESPACE(30B)