文件名称：harmonyos2-utility:TCR肿瘤浸润淋巴细胞单细胞实验集
文件大小：1.67GB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-21 08:54:56
系统开源
和声2 公用事业 使用 TCR 测序数据收集肿瘤浸润淋巴细胞单细胞实验 介绍 使用配对 TCR 测序组装公开可用的肿瘤浸润性 T 细胞 (TIL) 数据集的初衷是扩展和改进 R 包。 但是，经过一番讨论，我们决定为大家发布数据集，测序运行的完整摘要和样本信息可以在Seurat对象的元数据中找到。 该存储库包含用于数据集的初始处理和注释的代码（我们将此版本称为 0.0.1）。 这涉及几个步骤：1）加载相应的 GE 数据，2）通过样本和队列信息协调数据，3）通过自动注释进行迭代，4）通过手动检查和富集分析统一注释，以及 5）添加 TCR 信息。 此信息存储在 Seurat 对象的元数据中 - 每个变量的解释都可用。 队列信息 这是当前的数据源列表，通过组织类型过滤的细胞数量。 如果您使用实用程序，请引用数据！ 血液 尤斯塔 LN 普通的 瘤 癌症类型 添加日期 引文 CCR-20-4394 0 0 0 0 26760 卵巢 21 年 6 月 19 日 GSE114724 0 0 0 0 27651 胸部 21 年 6 月 19 日 GSE121636 12319 0 0 0 11436 肾