文件名称：ChIP-AP:染色质免疫沉淀测序分析管线
文件大小：92.66MB
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更新时间：2024-04-20 05:10:39
Python
芯片 CH romatin我mmuno P recipitation测序nalysis P ipeline 本质上简单的ChIP-Seq分析 由Jeremiah Suryatenggara和Mahmoud A.Bassal开发 介绍 ChIP-Seq是一种用于分析蛋白质-DNA相互作用并鉴定所述蛋白质的结合位点的技术。 生物信息学分析中的关键步骤是调用“峰”或富集区域，对应于蛋白质与DNA的结合位点。 据广泛报道，在所有生物信息学分析步骤中，最有可能影响研究结果的步骤是峰调用（Chen等，2012； Johnson等，2007）。 已经发表了许多评论（Koohy等，2014； Laajala等，2009； Wilbanks和Facciotti，2010），以高峰呼叫者为基准，以确定一个呼叫者相对于其他呼叫者的优越性。 但是，这些基准始终一致地报告了混合的，可能相互矛盾的发现，没有一个