文件名称:nextflu:实时跟踪流感演变
文件大小:31.66MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-03 02:41:45
JavaScript
当前状态 Nextflu的所有开发都已纳入Nextstrain项目。 Python构建pipine提供的(其将取代在构建管道blab/nextflu/augur )和JavaScript的可视化可在(其将取代可视化blab/nextflu/auspice )。 可在实时显示季节性流感的演变。 介绍 nextflu旨在对流感病毒的进化进行近乎实时的跟踪。 当前版本的nextflu着眼于血凝素(HA)基因的序列,着眼于追踪人类季节性流感的演变。 它分为两个部分: 推运器,这需要一个.fasta流感序列的文件并建立一个带注释的系统发育 auspice ,它在基于Web的交互式可视化中显示此带注释的系统发育 Augur构建脚本位于而可视化工具位于。 此存储库中保留了augur和auspice旧版v1版本,以供后代使用。 引文 请引用nextflu作为: 许可和版权 版权所有2014-20