【文件属性】：
文件名称：rBLAST:基本局部比对搜索工具（BLAST）的界面-R-Package
文件大小：25KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-10 14:16:10
bioinformatics bioconductor blast-search R
rBLAST-BLAST搜索的界面（R包）
连接基本局部比对搜索工具（BLAST），以使用Bioconductor基础结构搜索基因序列数据库。 这包括blastn ， blastp ， blastx和makeblastdb 。 BLAST软件需要单独下载和安装。
安装
安装软件包devtools 。
使用devtools::install_bioc("Biostrings")或直接从安装Bioconductor软件包Biostrings 。
使用devtools::install_github("mhahsler/rBLAST")从GitHub安装rBlast 。
按照? blast的说明安装BLAST软件? blast ? blast
用法
# # download the 16S Microbial data base from NCBI
download.file( " ft
【文件预览】：
rBLAST-master
----.gitignore(185B)
----NAMESPACE(189B)
----R()
--------BLAST.R(3KB)
--------makeblastdb.R(997B)
--------AAA.R(1KB)
----.Rbuildignore(132B)
----.travis.yml(308B)
----LICENSE(34KB)
----man()
--------makeblastdb.Rd(2KB)
--------BLAST.Rd(3KB)
----README.md(3KB)
----inst()
--------examples()
----appveyor.yml(712B)
----DESCRIPTION(651B)