文件名称：系统发育：在python中建立系统树的教程
文件大小：4.82MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-03 15:31:10
JupyterNotebook
用Python制作系统树的教程 该存储库包含一个教程和从python中的序列数据创建系统树的示例。 它旨在作为入门，并使用BioPython软件包中的模块。 完整的教程可在。 jupyter笔记本中的示例-请参见turtles.ipynb文件的turtles文件夹 python文件中的示例-查看sharks.py文件的sharks文件夹 jupyter笔记本中的大树示例-请参见coral.ipynb文件的coral文件夹 youtube 教程。
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phylogenetics-master
----turtles()
--------sequence7.fasta(653B)
--------turtles_cladogram.png(26KB)
--------sequence4.fasta(680B)
--------sequence2.fasta(682B)
--------sequence3.fasta(681B)
--------turtles.aln(6KB)
--------turtle_edited.nex(319B)
--------sequence6.fasta(619B)
--------turtle_tree.xml(2KB)
--------turtles.fasta(5KB)
--------turtle_tree.nex(349B)
--------turtles.ipynb(86KB)
--------sequence5.fasta(677B)
--------turtles2_cladogram.png(23KB)
--------turtles_simple.png(68KB)
--------sequence1.fasta(675B)
----images()
--------flow.png(209KB)
--------demo.gif(1.83MB)
--------animal_tree.png(45KB)
--------dummy_thumbnail.jpg(138KB)
--------joker_logo.jpg(9KB)
----index.md(16KB)
----coral()
--------coral_cladogram.png(746KB)
--------Coral.ipynb(828KB)
--------Huang&Roy_Molecular.tre(510KB)
----sharks()
--------shark_cladogram.png(2KB)
--------sharks.py(2KB)
--------sharks.fasta(100KB)
--------sharks.ipynb(43KB)
--------sequence4.fasta(17KB)
--------sequence2.fasta(17KB)
--------sharks.aln(162KB)
--------sequence3.fasta(17KB)
--------shark_tree.xml(1KB)
--------sequence6.fasta(17KB)
--------sequence5.fasta(17KB)
--------sequence1.fasta(17KB)
----pdf()
--------sample_presentation.pdf(1.77MB)
----LICENSE(1KB)
----_config.yml(377B)
----README.md(727B)
----_layouts()
--------default.html(3KB)