Swift Sequence Alignment Program:使用Smith-Waterman的基于GPU的DNA序列比对程序-开源

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文件名称：Swift Sequence Alignment Program:使用Smith-Waterman的基于GPU的DNA序列比对程序-开源
文件大小：467KB
文件格式：TGZ
更新时间：2021-04-30 20:20:34
开源软件 Swift是一个DNA序列比对程序，使用Smith-Waterman算法产生缺口比对。 它以查询文件（FASTA格式）和参考文件（FASTA格式）为输入。 它输出参考名称，读取名称，空位比对，比对得分，比对开始​​和结束位置以及比对长度。 我在2012年GPU技术大会上就Swift进行了演讲。可以在http://www.gputechconf.com/gtcnew/on-demand-GTC.php?sessionTopic=58&searchByKeyword=&submit=&select=+&sessionEvent=*问该演讲。 ＆sessionYear =＆sessionFormat =＃1303。 要安装和运行Swift，请参阅Wiki页面：http://sourceforge.net/p/swiftseqaligner/wiki/Home/如果您需要进一步的帮助来安装或运行Swift，请通过pankaj.gupta@stjude与Pankaj Gupta联系。 org。