文件名称：Kive:生物信息管道和数据的归档和自动化
文件大小：16.5MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-27 19:04:19
python version-control bioinformatics-pipeline Python
基夫 Kive是一个可访问的计算框架，用于生物信息管道及其输入和输出数据集的版本控制。 背景 生物信息学“管道”是用于处理和分析生物数据的软件程序的集合。 管道已成为现代生物医学和临床实验室中必不可少的工具。 大多数管道都是经过定制的，可以满足每个实验室和项目的要求。 因此，它们通常处于不断发展中。 最终用户通常不知道对管道进行的修订。 很难确定使用哪个版本的管道来处理给定的数据集，尤其是在有多个结果副本的情况下。 这使得难以再现用于方法验证或发布的结果。 临床实验室认证计划（例如，美国病理学家学院（CAP））对生物信息学管道的验证和版本跟踪发布了新的要求。 跟踪此信息的系统应该可以查找任何数据集的管道历史记录。 它应该易于使用，直观的图形界面以及尽可能多的自动“簿记”功能。 我们找不到符合这些条件的系统。 Kive是做什么的？ 我们开发了作为Django应用程序的新框架