文件名称:寻找最小数的matlab代码-CompBioClass:生物类
文件大小:31.53MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-08 23:19:26
系统开源
寻找最小数的matlab代码介绍 保罗·里瓦德(Paul Rivaud)编写了本教程,以帮助班上的人们适应数据的实际方面。 本教程解决了从头下载数据的一些问题-您当前未处理这些问题。 这里有大量有用的信息。 这个Github存储库包含数据文件和代码示例,可让您开始在Caltech教授的计算生物学课上学习。 本课程的目的是让学生使用编程语言(Julia,R,Python,Matlab等)分析一些单细胞测序数据。 该自述文件的内容如下: 一般信息Julia[R PYTHON 的MATLAB 一般信息 数据结构 单细胞测序数据通常存储为稀疏矩阵对象以应对数据低密度(约10-15%的条目为非零条目)。 使用稀疏矩阵在计算上效率更高,但是要跟踪行和列标签(存储在单独的数组中)需要更严格(提醒:数组索引在Python中从0开始,在Julia,R和Matlab中从1开始) 。 数据框对象(即,密集矩阵(R,Python))可以解决该问题,但往往执行速度较慢,并且在数据集变大时可能难以加载到内存中。 解压缩后,数据文件夹包含三个文件: matrix.mtx :基因表达矩阵及其各matrix.mtx和列
【文件预览】:
CompBioClass-master
----code_rsc()
--------hclust_heatmap()
----FinalExam()
--------final-exam-due-4.pdf(148KB)
--------Screen Shot 2018-03-11 at 10.54.38 PM.png(68KB)
----healthy2.csv.zip(5.82MB)
----Week1()
--------MacKay2.pdf(330KB)
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--------brainmuscle1.csv(699B)
----week2()
--------ProblemSet2_v3.pdf(131KB)
--------NNMF_Seung_Lee.pdf(162KB)
--------pset2syndata.csv(37KB)
--------sparse_pca.pdf(295KB)
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----healthy1.csv.zip(5.37MB)
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----aml2.csv.zip(10.11MB)
----gene_names_class.csv(45KB)
----README.md(22KB)