containerize-conda：将现有的conda环境转换为Docker或Singularity容器

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文件名称：containerize-conda：将现有的conda环境转换为Docker或Singularity容器

文件大小：2KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-03-23 12:58:35

Dockerfile

容器化现有的conda环境 我使用conda环境来进行数据分析项目。 有时，如果软件包不在bioconda或conda-forge上，则需要恢复使用pip或R的install.packages进行安装。 这使得很难在另一个系统上重现环境以及分析。 甚至存储为environment.yml文件的纯conda环境也可能损坏。 使用以下说明，可以将现有环境打包到Docker或Singularity容器中，该容器应具有更高的可移植性，并且还可以轻松地集成到基于的。 先决条件 Docker，Podman或Singularity 源conda环境必须在linux x64机器上。 用法 包装环境 conda-pack -n -o packed_environment.tar.gz 建造容器 # With singularity singularity build --fakero

【文件预览】：
containerize-conda-master
----.gitignore(15B)
----Dockerfile(97B)
----Singularity(213B)
----README.md(2KB)