文件名称：npg_docker:包含 Docker 的管道的原型
文件大小：9.28MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-24 20:37:10
Shell
npg_docker 最后更新：28/10/14 (sd15) 该存储库集中了 Stefan Dang 的安置项目 @ Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton 的各种小型原型。 这个为期 3 个月的项目的目的是探索在容器中包装不同对齐程序/管道的可能性，用于封闭环境中的生产或作为 Illumina BaseSpace Native Apps。 请参阅 Sanger Informatics Group Meeting 演讲的初步以获取更多精美插图。 概述 autobuild：用于管理在相同基础映像之上的单独 Docker 容器内的所有必需管道二进制文件的自动构建的脚本。 与在单个容器中构建所有二进制文件相比，这显着减少了构建时间和可维护性，同时仍然保留了虚拟化优势（例如可预测的环境、数据来源）。 basespace-smalt：在单个容器内部署
【文件预览】：
npg_docker-master
----basespace-smalt()
--------Dockerfile(2KB)
--------README.md(2KB)
--------basespace()
--------smalt_entrypoint.sh(4KB)
--------test()
----LICENSE(18KB)
----IGM-talk_docker-pipelines.pdf(3.39MB)
----orchestrated-containers()
--------private_registry()
--------testinput()
--------README.md(821B)
--------p4align.sh(2KB)
----README.md(2KB)
----p4()
--------Dockerfile(3KB)
--------README.md(575B)
--------test()
----autobuild()
--------baseimage()
--------autobuild.sh(1KB)
--------README.md(412B)
--------to-build()
----boot2docker-wrapper()
--------README.md(2KB)
--------b2d-wrapper.sh(3KB)