Bird_Perm_Analysis:鸟类基因组排列分析

时间:2024-07-28 18:37:45
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文件名称:Bird_Perm_Analysis:鸟类基因组排列分析

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更新时间:2024-07-28 18:37:45

R

Bird_Permutation_Analysis 首先,我检查了 1 比 1 人类到 anole 直向同源表中的重复项。 有两个: RPP14 被列出两次,具有两个不同的人类基因 ID。 两者都有相同的开始但不同的结局。 anole orthologs 有不同的开始,但在基因列表中接近并按顺序下降。 由于这两个条目将在两个基因的块中处理,因此在进行排列分析之前我从表中删除了第二个条目。 人类基因座:chr3:58291974-58305816,chr3:58291974-58305920 Anole 基因座:chr2:187318639-187323381,chr2:1873180318-186 LEKR1 类似地列出了两次,带有两个人类基因 ID。 基因座不同但在基因列表中接近并按顺序排列,因此我删除了第二个条目。 人类基因座:Chr3:156543270-156697347


【文件预览】:
Bird_Perm_Analysis-master
----OMIM_id_dist.pdf(5KB)
----OMIM_id_dist.png(16KB)
----Phenotype_count_dist.png(16KB)
----OmimID2description.txt(416KB)
----Chrom_dist_of_losses.txt(2KB)
----OrhologSet.txt(1.19MB)
----Gene2PhenoId.txt(18.77MB)
----OMIM_term_dist.pdf(5KB)
----.Rhistory(24KB)
----MissingGenes(274).txt(2KB)
----Mouse_pheno_perm.txt(1.74MB)
----Mouse_pheno_perm_q.txt(78KB)
----PhenoId2Pheno.txt(2.04MB)
----Bird_missing_gene_analysis.docx(36KB)
----Missing_gene_analysis.R(13KB)
----OMIM_term_dist.png(16KB)
----Phenotype_count_dist.pdf(5KB)
----README.md(4KB)
----GeneName2OMIMid.txt(267KB)

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