文件名称：matlab代码cox-tubule-tracker:用于跟踪视频中类似纤维的对象的代码。可以对光纤上的一个点进行跟踪，也可以跟踪整个轮廓
文件大小：564KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 14:22:54
系统开源
Matlab代码考克斯肾小管追踪器 编码以从荧光显微视频中跟踪类似纤维的物体。 可以对光纤上的一个点进行跟踪，也可以跟踪整个轮廓。 三个文件夹中有三种不同的跟踪/分析方法： 点跟踪和MSD计算 轮廓追踪 傅立叶分析 点跟踪和MSD计算 点跟踪代码要求用户定义一条垂直于纤维的线，然后通过拟合强度分布图，沿着该线跟踪细管的中心位置。 计算出该轨迹的均方根位移，并符合幂定律。 基于Georgiades等人（）的先前工作，并使用现有的MATLAB代码：和。 轮廓追踪 使用此代码，可以在视频的所有帧上跟踪类似纤维的对象的轮廓。 用户必须在第一帧中单击光纤的起点和终点，但是会自动跟踪其余的帧。 该代码很大程度上基于FiberApp（Usov＆Mezzenga（，）的开源软件）。 找到小管随时间的平均位置（或其主干），并计算沿主干的每个位置的方差和偏度。 这些点的任何明显偏斜都表明驱动运动。 傅立叶分析 使用上述轮廓跟踪代码找到的轮廓可以使用此代码分解为傅立叶模式。 随时间绘制每个模式的振幅，以显示曲率动力学。 基于Cox等人的工作。 执照 原始FiberApp软件的许可证如下：版权所有（c）201